MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 22807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007356	ACG	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747957
2	NC_007356	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	73747957
3	NC_007356	TAC	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747957
4	NC_007356	GCT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747957
5	NC_007356	ACAA	2	8	543	550	75 %	0 %	0 %	25 %	73747957
6	NC_007356	GCC	2	6	645	650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
7	NC_007356	CCG	2	6	752	757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
8	NC_007356	TCT	2	6	804	809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747957
9	NC_007356	GAA	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
10	NC_007356	GAT	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747957
11	NC_007356	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
12	NC_007356	CCCA	2	8	980	987	25 %	0 %	0 %	75 %	73747957
13	NC_007356	CCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
14	NC_007356	A	6	6	1066	1071	100 %	0 %	0 %	0 %	73747957
15	NC_007356	GCC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747957
16	NC_007356	ACA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73747957
17	NC_007356	CT	3	6	1439	1444	0 %	50 %	0 %	50 %	73747957
18	NC_007356	GAA	2	6	1471	1476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747957
19	NC_007356	AGCTGG	2	12	1513	1524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73747957
20	NC_007356	ACC	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747957
21	NC_007356	CGG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
22	NC_007356	CGG	2	6	2012	2017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
23	NC_007356	CGG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
24	NC_007356	CGG	2	6	2042	2047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
25	NC_007356	CTA	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747958
26	NC_007356	GGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747958
27	NC_007356	GGC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
28	NC_007356	AGGG	2	8	2293	2300	25 %	0 %	75 %	0 %	73747958
29	NC_007356	GCG	2	6	2368	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
30	NC_007356	TAT	2	6	2417	2422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747958
31	NC_007356	CTG	2	6	2460	2465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
32	NC_007356	TAC	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747958
33	NC_007356	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
34	NC_007356	GGT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747958
35	NC_007356	AGAT	2	8	2767	2774	50 %	25 %	25 %	0 %	73747958
36	NC_007356	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747958
37	NC_007356	AAG	2	6	2821	2826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747958
38	NC_007356	T	6	6	2841	2846	0 %	100 %	0 %	0 %	73747958
39	NC_007356	CTG	2	6	2880	2885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747958
40	NC_007356	GCG	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
41	NC_007356	AT	3	6	2926	2931	50 %	50 %	0 %	0 %	73747958
42	NC_007356	TGGC	2	8	3017	3024	0 %	25 %	50 %	25 %	73747958
43	NC_007356	ATT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747958
44	NC_007356	GGC	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747958
45	NC_007356	G	6	6	3214	3219	0 %	0 %	100 %	0 %	73747959
46	NC_007356	A	6	6	3268	3273	100 %	0 %	0 %	0 %	73747959
47	NC_007356	GGCTGG	2	12	3276	3287	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	73747959
48	NC_007356	TAT	2	6	3320	3325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747959
49	NC_007356	AAG	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747959
50	NC_007356	CTTTA	2	10	3497	3506	20 %	60 %	0 %	20 %	73747959
51	NC_007356	GCTGG	2	10	3508	3517	0 %	20 %	60 %	20 %	73747959
52	NC_007356	ATA	2	6	3560	3565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747959
53	NC_007356	GAT	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747959
54	NC_007356	CAG	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747959
55	NC_007356	AT	3	6	3687	3692	50 %	50 %	0 %	0 %	73747959
56	NC_007356	CTT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747959
57	NC_007356	CGG	2	6	3750	3755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747959
58	NC_007356	TAAA	2	8	3796	3803	75 %	25 %	0 %	0 %	73747959
59	NC_007356	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747960
60	NC_007356	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
61	NC_007356	TCC	2	6	4042	4047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73747960
62	NC_007356	CAT	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747960
63	NC_007356	AG	3	6	4186	4191	50 %	0 %	50 %	0 %	73747960
64	NC_007356	TAA	2	6	4222	4227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747960
65	NC_007356	GAA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747960
66	NC_007356	TGA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747960
67	NC_007356	TTC	2	6	4388	4393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
68	NC_007356	GCG	2	6	4469	4474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
69	NC_007356	ACC	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747960
70	NC_007356	CAGG	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	73747960
71	NC_007356	GCGG	2	8	4628	4635	0 %	0 %	75 %	25 %	73747960
72	NC_007356	GGC	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747960
73	NC_007356	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747960
74	NC_007356	TTC	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
75	NC_007356	ACGT	2	8	4838	4845	25 %	25 %	25 %	25 %	73747960
76	NC_007356	CCG	2	6	4950	4955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
77	NC_007356	T	6	6	5048	5053	0 %	100 %	0 %	0 %	73747960
78	NC_007356	TA	3	6	5057	5062	50 %	50 %	0 %	0 %	73747960
79	NC_007356	ACC	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747960
80	NC_007356	TAA	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747960
81	NC_007356	TCG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747960
82	NC_007356	AT	3	6	5172	5177	50 %	50 %	0 %	0 %	73747960
83	NC_007356	TTG	2	6	5190	5195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73747960
84	NC_007356	GTCA	2	8	5219	5226	25 %	25 %	25 %	25 %	73747960
85	NC_007356	GTG	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747960
86	NC_007356	GTG	2	6	5283	5288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747960
87	NC_007356	CTT	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747960
88	NC_007356	CCG	2	6	5442	5447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
89	NC_007356	GCC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747960
90	NC_007356	GTA	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747960
91	NC_007356	TTA	2	6	6058	6063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747961
92	NC_007356	GTG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
93	NC_007356	T	6	6	6190	6195	0 %	100 %	0 %	0 %	73747961
94	NC_007356	ACCC	2	8	6230	6237	25 %	0 %	0 %	75 %	73747961
95	NC_007356	TTC	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
96	NC_007356	TC	3	6	6311	6316	0 %	50 %	0 %	50 %	73747961
97	NC_007356	TTC	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
98	NC_007356	GCA	2	6	6419	6424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747961
99	NC_007356	AGGT	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	73747961
100	NC_007356	TGG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
101	NC_007356	G	6	6	6503	6508	0 %	0 %	100 %	0 %	73747961
102	NC_007356	ACC	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
103	NC_007356	CTG	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73747961
104	NC_007356	GAG	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73747961
105	NC_007356	TGA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73747961
106	NC_007356	GTTC	2	8	6714	6721	0 %	50 %	25 %	25 %	73747961
107	NC_007356	CTT	2	6	6725	6730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
108	NC_007356	TCTT	2	8	6816	6823	0 %	75 %	0 %	25 %	73747961
109	NC_007356	GGT	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73747961
110	NC_007356	ACC	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
111	NC_007356	T	6	6	6852	6857	0 %	100 %	0 %	0 %	73747961
112	NC_007356	AAAGAC	2	12	6995	7006	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73747961
113	NC_007356	TTC	2	6	7046	7051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
114	NC_007356	TCT	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
115	NC_007356	CGG	2	6	7132	7137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
116	NC_007356	GGC	2	6	7154	7159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
117	NC_007356	CGG	2	6	7237	7242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
118	NC_007356	GTTTG	2	10	7262	7271	0 %	60 %	40 %	0 %	73747961
119	NC_007356	ATC	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73747961
120	NC_007356	GGC	2	6	7465	7470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
121	NC_007356	T	7	7	7494	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	73747961
122	NC_007356	AT	3	6	7676	7681	50 %	50 %	0 %	0 %	73747961
123	NC_007356	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
124	NC_007356	CCA	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73747961
125	NC_007356	GCC	2	6	7847	7852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747961
126	NC_007356	TCT	2	6	7866	7871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73747961
127	NC_007356	T	6	6	7943	7948	0 %	100 %	0 %	0 %	73747961
128	NC_007356	GCG	2	6	8112	8117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	73747961
129	NC_007356	CCT	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73747961
130	NC_007356	G	6	6	8157	8162	0 %	0 %	100 %	0 %	73747961
131	NC_007356	AGA	2	6	8354	8359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73747962
132	NC_007356	GCA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73747962
133	NC_007356	GCC	2	6	8406	8411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
134	NC_007356	GCC	2	6	8418	8423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73747962
135	NC_007356	GCATG	2	10	8603	8612	20 %	20 %	40 %	20 %	73747962
136	NC_007356	TTA	2	6	8639	8644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73747962
137	NC_007356	ATA	2	6	8754	8759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73747962
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266	NC_007356	TA	3	6	16274	16279	50 %	50 %	0 %	0 %	73747970
267	NC_007356	TA	3	6	16294	16299	50 %	50 %	0 %	0 %	73747970
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